No. Ambas frases son incorrectas y se corrigen como sigue:
...la altura máxima de aspiración d̶e̶ ̶l̶a̶ del agua de refrigeración (antes de arrancar el motor diesel, todos los espacios interiores de la bomba hidráulica deben ser llenados con ̶l̶a̶ agua)...
¿Por qué se cambia por el masculino?: Cuando la palabra comienza por [a] tónica se cambia en el singular por el masculino. Ej: El agua/Las aguas, el águila/las águilas. Ver Why is “agua” masculine in singular form and feminine in plural? “El agua” / “Las aguas”
En la segunda frase se habla del agua en "genérico" y por lo tanto no necesita artículo. Si el agua que debe usarse es "específica" se pude usar el articulo el, por ejemplo:
... los espacios interiores de la bomba deben llenarse con el agua que teníamos reservada para esto.