Como verbos que no tengan sustantivos relacionados para expresar su acción, tenemos que irnos a lo más básico: el verbo ser. Se podría argumentar que la propia palabra ser como sustantivo es su propia acción, pero yo personalmente no lo tengo claro. Una de las acepciones de ser, "existir", sí podría tener un sustantivo de acción: existencia, que es el acto de existir, aunque esto no cubre todas las demás acepciones de ser. Argumentan por La Tertulia que su sustantivo podría ser esencia, pero no aparece en el DLE con el significado de "acto de ser" o similar. ¿Tal vez en latín sí tenía ese significado?
Tampoco tengo claro que el verbo haber tenga su acción correspondiente, claro que por sí solo como verbo auxiliar no tiene mucho sentido, y con otros significados tenemos tenencia o posesión en su acepción de "poseer", acontecimiento en su acepción de "ocurrir" o "acontencer", etc. Similar al caso de ser es el de poder, existe el sustantivo poder pero no tengo claro que indique el acto de poder. ¿Tal ver potencia sería su sustantivo de acción?
Y luego como sustantivo con una raíz diferente del verbo tenemos hacer, que tiene un sustantivo en acto o en acción, que es el "ejercicio de la posibilidad de hacer".